本校於民國42年成立，為新竹縣立第一中學湖口分部。同年秋季，招收新生兩班；次年又收三班。民國44年再收新生三班，共計八班，學生共四百六十名。45年8月，教育部指定新竹縣試辦，「國小畢業生免試升學」，本校正式成立為新竹縣湖口初級中學，派李薈為本校首任校長，並定10月15日為本校校慶日。

46年11月李薈校長他調，改派易用莊校長接任。48年2月，改派王玉書校長。57年秋，延長九年國教，本校奉命依制改為新竹縣立湖口國民中學，由鄧迅之校長接任。67年改派李左彰校長。77年7月李左彰校長退休，由黃宗謀校長接任。

黃宗謀校長任內廢除校內破舊宿舍並改建為停車場、新建一棟專科教室、行政大樓擴充整建、重新興建廁所、並將原有校舍全面翻修、運動場重新修整。另外校地徵收、開闢網球場、興建體育館、校門改建、校道拓寬、充實教學設備于焉大成。86年7月，本校奉命改制為完全中學，校名定為新竹縣立湖口中學，並配合高一新生入學，增建教室六間、教學大樓一棟及科學大樓一棟、軟硬體設備共五十多項。及至88年4月，所有主附體及周邊圍牆美化、綠化等工程全部完成竣工。同年7月並完成高中教師甄選工作。

至此，本校為新竹縣唯一所縣立完全中學，各界期望甚殷，全體師生在黃宗謀校長領導下莫不全力以赴，以期辦好此一歷史性教育改制之工作。90年9月黃宗謀校長榮退，詹輝男校長接任，繼續領導學校推動校務發展。91年招收體育班，92年奉命改制為新竹縣立湖口高級中學。

97年2月余保生校長接任本校，繼續領導學校推動校務發展。102年7月余校長榮退。改由張華堂校長接任本校，領導全校師生，承先啟後。

張華堂校長到任本校後，勠力校園和諧氣氛營造，及提升優質校園文化，尤其激勵師生實踐學校願景健康、品德、適性、卓越不遺餘力，並致力推動高中優質化，107年通過教育部優質高中認證，積極發展校務，務求一切以學生為第一，教師為重。張校長於110年7月31日榮退。

110年8月1日由姜錢珠校長接掌湖中，姜校長到任後，積極發展各項校務，從十二年國教基本素養理念著手，重視生活教育與品德教育，提供多元學習機會，同時扶弱托底拔尖並進，協助孩子適性發展，創造多元展能的舞台；更積極推動各項國際教育與雙語教育計畫，改變舊有校內環境，將國際教育理念融入課程，以及將國際、雙語元素建置於校園環境中，透過課程與文化交流，培養學生尊重、包容、欣賞不同文化，培養具備國際觀的世界公民。

為因應學制發展與教育政策調整，原本實施「國中部＋高中部」之完全中學體制，自114年8月1日起正式分立為湖口高中及湖口國中兩所獨立學校，114學年度起由張明智校長接任本校。